根据省委、省政府批准的《东营市人民政府机构改革方案》(鲁委［2000］273号)和《中共东营市委、东营市人民政府关于东营市人民政府机构改革实施意见》(东发［2001］7号)，保留东营市水利局。市水利局是主管全市水行政工作的市政府工作部门。
　　一、职能调整
　　(一)划出的职能
　　将在宜林地区以植树、种草等生物措施防治水土流失的行政管理职能，交由市林业局承担。
　　(二)划入的职能
　　1、原市地质矿产局承担的地下水资源行政管理职能。开采矿泉水、地热水，先由市水利局办理取水许可证。
　　2、原市建设委员会承担的城市规划区范围内地下水资源管理、保护职能。
　　(三)增加的职能
　　新建和扩建向水域排污口应事先征得水行政主管部门的同意。
　　(四)转变的职能
　　1、加强水资源的统一管理保护、水质监管、水利执法和节约用水的职能，弱化微观管理职能，将有关技术性、服务性职能交由事业单位承担。
　　2、以下四项职能交由县级水利行政主管部门，市级不再办理。
　　(1)开垦禁止开垦坡度以下、五度以上的荒坡地，开垦国有荒坡的审批。
　　(2)渠堤、输水建筑物以上的交通桥确需兼作公路的审批。
　　(3)河道采砂、取土等许可。
　　(4)在灌区工程保护范围内从事打井、钻探、爆破等危害工程安全活动许可。
　　二、主要职责
　　结合以上职能调整，市水利局的主要职责是：
　　(一)贯彻执行国家和省有关水利工作的方针政策和法律法规，拟定全市水利发展战略和中长期规划，组织起草全市水利工作的政策措施和实施办法，并监督实施。
　　(二)统一管理水资源。组织拟定全市和跨县区水长期供求计划、水量分配方案并监督实施；组织有关国民经济总体规划、城市规划及重点建设项目的水资源和防洪的论证工作；组织实施取水许可制度和水资源费征收制度；发布全市水资源、水质监测公报；指导全市水文工作。
　　(三)拟定节约用水政策措施，编制节约用水规划，制定有关标准，组织、指导和监督节约用水工作。
　　(四)按照国家资源与环境保护的有关法律法规和标准，拟定全市水资源保护规划；组织水功能区的划分和向饮水区等水域排污的控制；监测地表水和地下水的水量、水质，审定水域纳污能力；提出限制排污总量的意见；审定向水域排污的新建和扩建排污口。
　　(五)组织指导水政监察和水行政执法；协调并仲裁部门间和县区间的水事纠纷；受市政府委托协调处理市际间的水事纠纷。
　　(六)负责水费等水行政收费的征收管理工作。
　　(七)拟定水利行业的经济调节措施；对水利资金的使用进行宏观调节；指导水利行业的供水及多种经营工作；研究提出有关水利的价格、税收、信贷、财务等经济调节意见；监督管理水利系统国有资产的保值增值。
　　(八)编制、审查市内大中型水利基建项目建议书和可行性报告；组织水利科学研究和技术推广；监督实施水利工程的规程、规范和水利行业技术质量标准；负责水利工程招标投标、监理的监督。
　　(九)组织指导水利设施、水域、河道及其岸线的管理与保护；组织指导河道、水库及河口滩涂、海堤的治理和开发；组织建设和管理具有控制性或跨县区的重要水利工程；组织指导水库大坝的安全监管。
　　(十)指导农村水利工作；组织协调农田水利基本建设、人畜饮水、节水灌溉和乡镇供水工作。
　　(十一)组织指导全市水土保持工作；研究制定水土保持区划、规划并监督实施，组织水土流失的监测和综合防治；承担市水资源委员会、水土保持委员会的日常工作。
　　(十二)负责水利方面的科技和外事工作，指导全市水利队伍建设。
　　(十三)承担市防汛抗旱指挥部的日常工作，组织、协调、监督、指导全市防汛抗旱工作，指导城市防洪工作；发布水利信息，管理水利信息网络；对较大河道、水库和重要水利工程实施防汛抗旱调度。
　　(十四)负责本部门及部门职责范围内的安全工作。
　　(十五)承办市委、市政府交办的其他事项。
　　三、内部机构
　　根据上述职责，市水利局设7个科室。
　　(一)办公室
　　协助局领导协调机关日常工作，负责机关文秘、信息、档案、机要、保密、信访、督查、接待、综合治理、安全生产、会议安排和综合性文稿的起草及规章制度建设；组织调查研究，掌握全市水利工作动态；负责局机关及所属事业单位户口管理和计划生育工作。
　　(二)人事科(离退休人员管理科与其合署)
　　负责局机关并指导局直属单位的人事管理、劳动工资、机构编制、社会保障、离退休人员管理等工作；组织局管干部、公务员及科技干部的培训；承办局管干部的管理；指导局直属单位的劳动保护工作；指导水利行业职工队伍建设。
　　(三)财务科
　　草拟全市水利行业的经济调节措施，对水利资金的使用进行宏观调节；研究提出有关水利的价格、税收、信贷、财务等经济调节意见；管理、监督国家、省、市拨水利经费的使用；对全市水利系统国有资产进行监督管理；指导局属单位的财务工作；负责局机关的财务管理和行业内审工作。
　　财务科的主要工作人员由市财政局委派，工作运行和机构管理按照会计委派制试点的有关规定执行。
　　(四)规划计划科
　　组织编制全市水利发展战略、中长期发展规划和年度计划；组织草拟水长期供求计划；承办全市大中型水利基建项目建议书和可行性报告的编制、审查工作；组织编制流域综合规划和专项规划，协调流域开发工作；负责水利方面的科技和外事工作；承办全市水利综合统计分析工作。
　　(五)水政法规科
　　草拟全市水利法制建设规划；研究提出有关水利方面的政策措施，组织拟定有关规范性文件和改革方案；实施指导水政监察和水行政执法工作，承办县区和部门间的水事纠纷协调的有关工作；承办局行政应诉、复议和普法教育工作。
　　(六)农村水利科
　　研究草拟全市农村水利的发展规划和政策措施；指导全市农田水利基本建设和农村水利社会化服务体系建设；组织拟定大型灌区规划；指导乡镇供水和农村节约用水工作；指导农田水利工程管理制度的改革；指导引黄灌溉和农业综合开发水利项目工作。
　　(七)水资源科(挂市节约用水办公室牌子)
　　负责全市水资源统一规划、管理和保护工作；组织实施取水许可制度和水资源费征收制度，拟定各县区水量分配方案并组织实施；指导全市计划用水、节约用水和城市供水的水源规划；负责组织水功能区的划分和向饮水区等水域排污的控制；组织监测地表水、地下水的水量、水质，审核水域纳污能力，提出限制排污总量的意见；负责区域内所有重大项目和工程进行水资源论证和水环境影响评价，组织对破坏水环境与生态的活动建立补偿机制；承办向水域排污新建和扩建排污口的审批工作；指导全市水文工作。
　　四、人员编制
　　市水利局机关编制总额32名，其中，行政编制21名，离退休工作人员编制8名，工勤人员编制3名。可配备局长1名，副局长3名；科级领导职数12名。
　　纪检、监察机构和人员编制按这次机构改革的有关规定执行。
　　五、其他事项
　　(一)在河道内开采砂石先经水行政主管部门批准，并发放《采砂许可证》，征收管理费；国土资源主管部门根据水行政主管部门批准的开采范围和开采限量，办理《采矿许可证》，并征收矿产资源补偿费。
　　(二)荒丘、荒滩、荒沟治理开发由市水利局归口管理，负责制定治理开发规划，搞好综合协调；市国土资源局等部门按照各自的职责配合做好有关管理工作。
　　(三)水行政主管部门应将水资源保护规划、水功能区划和水质监测的有关情况、数据及审定的水域纳污能力、限制排污总量的意见及时通报环境保护行政主管部门。
　　(四)市水利局拟定节约用水政策，编制节约用水规划，制定有关标准，指导全市节约用水工作。建设部门负责指导城市采水和管网输水、用户用水中的节约用水工作并接受水利部门的监督。